微生物發(fā)酵和細胞培養(yǎng)的目標產物主要有菌體、胞內產物和胞外產物三類物質。

從發(fā)酵液和細胞培養(yǎng)液中提取所需的生化物質，第一步就需進行預處理，以便于固液分離，使代謝產物后續(xù)的分離純化工序順利進行。其原因有三個方面：首先，發(fā)酵液多為懸浮液，粘度大，為非牛頓型流體，不易過濾，而所需的生化物質往往只有分布在液相，才能有效地提純。并且，在有些發(fā)酵液中，菌體自溶，核酸、蛋白質及其他有機粘性物質這三類物質會造成濾液混濁、濾速極慢，必須設法增大懸浮物的顆粒直徑，提高沉降速度，以利于過濾；其次，目標產物在發(fā)酵液中的濃度通常較低；此外，發(fā)酵液的成分復雜，大量的菌絲體、菌種代謝物和剩余培養(yǎng)基會對提取造成很大的影響。所以，對發(fā)酵液進行適當的預處理，從而分離細胞、菌體和其他懸浮顆粒（如細胞碎片、核酸以及蛋白質的沉淀物），并除去部分可溶性雜質和改變發(fā)酵液的過濾性能，是生化物質分離純化過程中必不可少的首要步驟。

   預處理方法要根據發(fā)酵產品、所用菌種和發(fā)酵液特性來選擇。大多數發(fā)酵產品存于發(fā)酵液中，少數存于菌體中，而發(fā)酵液和菌體中都有產物存在的情形也比較常見。如果目的產物是胞外產物，則通過離心或過濾實現(xiàn)固液分離，使其轉入液相；而對于胞內產物而言，收集細胞是預處理的首要一步。細胞經破碎或整體細胞萃取使目的產物釋放，轉入液相，再進行細胞碎片的分離。如果所需的產物為細胞，離心或過濾所得固相經干燥等過程就可得到菌體。